距圣诞节仅有8天时间，SOS团在凉宫春日的号召下，不出意料地策划了一场圣诞狂欢派对。但就在12月18日这天早晨，阿虚却发现周围的世界有了些许变化。1年9班消失不见，朝比奈学姐视其形同路人，甚至早已死去的朝仓也代替凉宫春日坐在了阿虚的后面，而春日则如同人间蒸发一般无人知晓。当他冲向SOS团的教室时，只看到了孤零零坐在角落里看书的长门有希，一向淡定自若、冷如冰霜的长门大神也变成了怯懦害羞的乖乖女。从前...

故事背景为架空世界“碧岛”，这座位于日本列岛西南方的岛屿，被财团改造成宏大华丽的白金牢笼。本作主人公是濑良垣苍叶（私市淳 配音），在旧住民区一家“平凡”商店里打工，犬型智能伴侣“莲”常伴其左右，好友红雀（高桥广树 配音）亦对其照顾有加。然而从以前开始，苍叶就一直忍受着原因不明的头痛。同时，岛内又开始流行起一种虚拟对战游戏——“莱姆”。一向对此毫无兴趣的苍叶，某天在送货路上，突然被一名神秘人物拉入了...